Franz Bergmann studierte an der TU München und Ludwig-Maximilians-Universität München Bioinformatik. Bereits während des Hauptstudiums arbeitete er als Junior Consultant im Bereich Datenbanken & Reporting. Seine Promotion in den Fächern Mikrobiologie und Isotopen Geochemie absolvierte er am HelmholtzZentrum München und der TU München. Anschließend war er als Life Science Consultant mit den Schwerpunkten Due Dilligence Bewertung, Marktanalyse und Arzneimittellogistik tätig. Mit dem Wechsel zur advanceCOR GmbH 2012 übernahm er dort zum einen die Abwicklung des Projekttransfers im Rahmen des Corimmun-Verkaufs an Janssen-CILAG/Johnson & Johnson, so wie das Management der klinischen Entwicklung und des GCP-Bereiches.
Franz Bergmann ist seit Januar 2021 im Team der ISAR Bioscience und koordiniert den Forschungsverbund „BASE-Lipid“. Daneben ist er verantwortlich für den Bereich Finanzen einschließlich Drittmittel sowie Spin-Off Konzeption.